Christophe Equey a dirigé pendant un peu plus de 17 ans la Fondation de Vernand qui est une grande institution sociale vaudoise qui accueille et accompagne près de 600 enfants et adultes présentant une déficience intellectuelle ou des troubles du spectre de l’autisme. Il est, ou a été, actif dans plusieurs Conseils de Fondation.

Il préside le Conseil de la Fondation Coup d’Pouce et celui de la Fondation CSC St-Barthélemy et siège au sein du Conseil de la Fondation d’aide sociale et culturelle, qui est l’organe vaudois de répartition des bénéfices de la Loterie romande.

Il a assumé durant trois ans la vice-présidence de la Fondation BVA. Il a également exercé la fonction de commissaire avec attributions de président, nommé par l’Autorité de surveillance LPP et des Fondations de Suisse occidentale, pour la Fondation Apollo qui traversait d’importantes difficultés.